Mereo BioPharma與Ultragenyx共享setrusumab的成敗：Ultragenyx負責全球開發並向Mereo供藥，雙方按各自銷售區域的銷售額向對方支付權利金。因此，Mereo在歐洲經濟區、英國和瑞士的銷售將為Ultragenyx帶來權利金收入。

Ionis Pharmaceuticals與Ultragenyx都在開發透過反義技術改變基因表現的藥物，競爭治療Angelman症候群的根本病理機制。可將Ionis的obudanersen試驗結果與Ultragenyx處於第三期的apazunersen（GTX-102）對照關注；目前尚無針對該病根本機制的核准藥物。

Ultragenyx仰賴雷傑納榮製藥供應Evkeeza，向其採購後在美國以外銷售，而雷傑納榮製藥負責美國市場。對Ultragenyx更有參考意義的是雷傑納榮的Evkeeza在同型合子家族性高膽固醇血症患者中的需求，而非其更廣泛的藥品業務。

Abeona Therapeutics將治療MPS IIIA的UX111基因療法授權給Ultragenyx，由後者負責該計畫，但仍分享其商業化收益。取得主管機關核准後，UX111銷售可觸發支付給Abeona的銷售里程碑款及淨銷售額權利金。

Denali Therapeutics正在開發為MPS IIIA患者補充酵素的DNL126，與Ultragenyx的UX111基因療法爭取同一患者群體。在這個尚無核准藥物治療的疾病領域，DNL126的臨床結果是值得對照關注的訊號。

Arcturus Therapeutics的ARCT-810採用mRNA藥物路線，與Ultragenyx治療OTC缺乏症的基因療法競爭。對Ultragenyx這項計畫更有參考價值的是ARCT-810的第二期結果，而非Arcturus的疫苗銷售。

Ultragenyx的OTC缺乏症及GSDIa計畫使用REGENXBIO授權的基因遞送技術，須支付維護費、里程碑款和權利金；REGENXBIO也開發自己的罕見疾病基因療法。應關注授權範圍和開發期限：該協議於2025年11月終止了部分適應症的授權，且Ultragenyx對授權專利的控制權有限。

Beam Therapeutics的BEAM-301透過基因編輯治療帶有R83C變異的GSDIa患者，與Ultragenyx的GSDIa基因療法計畫競爭。應重點關注BEAM-301在這個患者群體中的開發進展；Beam目前尚無產品銷售營收。